Ia dikirim menggunakan alat bernama Animus yang bisa memunculkan gambaran ingatan manusia melalui DNA keturunannya.
Animus mulai bekerja dan menemukan DNA Aguilar dalam diri Callum.
Aguilar adalah salah seorang Assassin’s yang tinggal di Andalusia pada sekitar tahun 1492.
Callium kini sudah menjadi Aguilar. Animus membawa Callum menuju ke sebuah desa di Andalusia, Spanyol.
Misinya yakni menyelamatkan nyawa Pangeran Ahmed de Granada yang telah diculik oleh Tomas de Torquemada.
Saat Aguilar hendak menyelamatkan Pangeran Ahmed de Granada, tiba-tiba dirinya disergap oleh pasukan Tomas de Torquemada.
Sayangnya, Aguilar berhasil ditangkap oleh pasukan Templar. Sadar jiwa Callum dalam bahaya, pihak Abstergo mulai kembali menarik kembali Callum menuju masa depan.
Bagaimanakah kelanjutan misi berbahaya dan penuh kecanggihan ini?
